بررسی تنوع ژنتیکی لاین های امید بخش جودیم دو ردیفه و شش ردیفه با استفاده از نشانگر مولکولی ssr

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های جو دیم، از 14 جفت آغازگر ssr بر روی 20 ژنوتیپ جو استفاده شد. استخراج dna به روشdart با اندکی تغییر انجام شد و dna با کیفیت مناسب به دست آمد. 14 جفت آغازگر در مجموع 424 باند چند شکل تولید نمودند که تقریباً 54/99 درصد از کل 426 عدد باند تولید شده را شامل گردید. در این مطالعه متوسط تعداد باند به ازای هر آغازگر 43/30عدد و برای هر ژنوتیپ 21/3 عدد بود. هم چنین متوسط تعداد باند چند شکل به ازای هر آغازگر 1/72 عدد بود. از کل تعداد باندها، بیشترین تعداد مربوط به آغازگرهای hvm60 و hvm20 با 54 و43 عدد باند و کمترین تعداد مربوط به آغازگرهای bmag0223 و bmac0032 با 20 عدد باند بود. میزان اطلاعات چند شکلی (pic) برای هرآغازگر محاسبه شد. از بین آن ها بیشترین pic مربوط به آغازگرهای hvm60 و hvm20 به ترتیب با مقادیر0/88و 0/73بود و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر bmac0032 با مقدار 0/32 بود. میانگین picبرای کل آغازگرها 6/24به دست آمد. با محاسبه ضریب تشابه جاکارد، ارزش های تشابه بین ژنوتیپ ها دامنه ای از 0/3 تا 0/96 را داشتند. بیشترین تشابه ژنتیکی مربوط به ژنوتیپ های شماره 6 (رقم زراعی) و شماره 5 (لاین امید بخش) با 0/96 بود و کمترین تشابه مربوط به ژنوتیپ های شماره 13 (پوشینه دار) و شماره 10 (پوشینه دار) با 0/3 بود. در این پژوهش دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای به روش upgma و با استفاده از نرم افزار ntsysاستفاده شد. با ترسیم خط برش در فاصله 0/75، ژنوتیپ های مورد مطالعه در 5 گروه اصلی قرار گرفتند. تفکیک بر اساس داده های مولکولیssr تا حدودی توانست ژنوتیپ های دو و شش ردیفه و همچنین ژنوتیپ های دانه پوشیده و بدون پوشینه را از هم تفکیک نماید. نتایج مطالعه ما بر روی جو دیم با آغازگرهای ssr، نشان داد که این آغازگرها در گیاه جو کارایی بالایی دارند و نشانگرهای مورد استفاده توانستند تمامی ژنوتیپ ها را به خوبی از هم جدا و بازشناسی کنند.